То е отделено от Вътрешното отделение и е създадено още през 1945 г. от педиатрите д-р Симеон Белопитов и д-р Аспарух Панов, който след 9 септември 1944 г. става началник на Детското отделение. Тук работи и друг отличен диагностик, също педиатър - д-р Спиро Димитров. Тогава то разполага със 75 легла, разпръснати в 3 помещения в различните краища на болничния двор. От 1973 г. е събрано в досегашната си база.
Дейността на шепата инфекционисти е много трудна и напрегната: в страната избухват и бавно затихват епидемии от скарлатина, дифтерит, детски паралич, паротит, хепатит, салмонелоза. Работят без защитно работно облекло, нямат дори и маски; работният им ден е нерегламентиран; за допълнителни отпуски не могат и да мислят. Независимо от тоталитарните времена, се престрашават да издигнат синдикални искания и за учудване те са удовлетворени.
Отделението последователно е ръководено от д-р Стела АСТРУКОВА и д-р Елка МАРИНКОВА. Наистина самоотвержено тук работят десетина непознаващи умората лекари, като д-р Николай Стоянов, д-р Иван Лазаров, д-р Катя Кръстева, д-р Димитър Власарев, д-р Мария Биволарска, д-р Евгения Такова, д-р Георги Везенков, д-р Тодорка Нодинска, д-р Антоанета Кунева, д-р Евгения Такова, д-р Катя Пещерска. Непременно трябва да бъде спомената и всеотдайната им помощничка, дългогодишната ст. м. с. на отделението – Мария Генова, която без колебание напуска високия си пост – главна сестра на болницата, за да отдаде силите си на тази толкова тежка работа.
От м. януари 1991 г. – вече 18 години! - ръководител на инфекционистите е д-р Петър ПЕТРОВ. При него работят 7 лекари. Вярно е, че вследствие масовите имунизации не се срещат старите епидемии, но и без тях работата на тези всеотдайни лекари е достатъчно напрегната и, най-жалкото - неблагодарна и недооценена, като на всички педиатри и инфекционисти в България.
Инфекциозното атделение разполага с 20 легла, през които през м. г. са преминали 1360 болни, предимно с хепатит А и чревни инфекции.
Старши ординатор е д-р Недялка Тодорова.
Ст. м. с. е Марина Игнатова.