Открито е през м. юли 1945 г. от д-р Йордан ЦАНЕВ, специализирал преди това в Първо вътрешно отделение. Тогава е възприета и се налага полезната практика на аутопсията да присъства най-малко лекуващият лекар на починалия пациент, а често пъти - и почти целият лекарски състав на съответното отделение; каква по-добра школа за всички тях?

Когато при аутопсиите се отбелязва някакво несъответствие между клиничната и патолого-анатомичната диагноза, се провежда сериозно разглеждане в болничната Контролна лекарска комисия; по нейно решение случаят се разглежда и обсъжда на общоболничен лекарски колегиум. Още през 1950 г. тук се въвежда дотогава невижданото в столицата изследване със замразяващ микротом (Гефрир) за експресна хистологична диагноза, което неимоверно улеснява хирурзите; в това отношение болницата отново е сред пионерите в България!

След пенсионирането на д-р Цанев постът му се заема от д-р Аврам ИСАКОВ, който не само снабдява отделението с нова апаратура и въвежда фотодокументацията, но и публикува и изнася редица интересни и ценни съобщения от своите наблюдения.   

В болницата е имало разкрит и Кабинет по съдебна медицина, основан от д-р Гергин ЗАХАРИЕВ. След ранната му смърт в него работят, тихо и скромно, д-р Петров и д-р Тончевска. В момента този кабинет не съществува.

         Днешният ръководител на Отделението по патологоанатомия е д-р Стефан ПЕТРОВ, който няма помощници и на практика единствен е извършил всичките 51 обдукции през 2008 г. Това отделение е изключително важно за точното диагностициране, а оттам – и за адекватното и успешно лечение. 3-те лаборантки на хистологичната му лаборатория са изработили общо 26 296 морфологични изследвания.

         Ст. мед. лаборант е Златка Тонова.